ผลการศึกษาตลอดทุกช่วงฤดูกาล พบว่าแพลงก์ตอนพืชกลุ่มเด่นที่พบเป็นจำนวนมากและพบได้ในทุกสถานีศึกษา ได้แก่ แพลงก์ตอนพืชสาหร่ายสีเขียว (Division Chlorophyta) ในกลุ่มเดสหมิด (Desmids) ซึ่งเป็นแพลงก์ตอนพืชที่มีลักษณะโดดเด่นเฉพาะตัวคือ เซลล์ที่มีรูปร่างเหมือนกันแบ่งออกเป็น 2 ส่วน (Semi-cell) และมีรอยคอดระหว่างเซลล์ มีทั้งเป็นเซลล์เดี่ยวและต่อยาวเป็นเส้นสาย ชอบอาศัยอยู่ในแหล่งน้ำที่มีคุณสมบัติเป็นน้ำอ่อน และสามารถบ่งชี้ถึงคุณภาพแหล่งน้ำที่ดีได้ ตัวอย่างเดสหมิดที่พบในหนองหารปริมาณมาก ได้แก่ Hyalotheca, Staurastrum และ Cosmarium เป็นต้น ขณะที่เดือนพฤศจิกายน 2560 พบว่าแพลงก์ตอนกลุ่มไดโนแฟลกเจลเลต (Dinoflagellate) ได้แก่สกุล Peridinium และ Ceratium นั้นเป็นกลุ่มเด่นที่สุดและมีปริมาณมากกว่าแพลงก์ตอนพืชชนิดอื่น ด้วยแพลงก์ตอนพืชทั้งสองสกุลนี้มีความสามารถในการอยู่รอดได้ในแหล่งน้ำทุกสภาวะ เช่น แหล่งน้ำที่มีความขุ่นมาก แหล่งน้ำอุณหภูมิสูง หรือแหล่งน้ำธาตุอาหารต่ำ และเป็นแพลงก์ตอนที่มีรูปแบบการกินอาหารได้หลากหลาย จึงทำให้ไดโนแฟลกเจลเลตสามารถเจริญเติบโตได้ดีแม้ว่าแหล่งน้ำหนองหารจะอยู่ในช่วงปรับตัวหลังเหตุการณ์อุทกภัยก็ตาม
ความหนาแน่นของแพลงก์ตอนพืชที่พบในแต่ละสถานีศึกษา ในเดือนพฤศจิกายน 2560 พื้นที่ที่มีปริมาณแพลงก์พืชมากที่สุด ได้แก่ สถานี NH5 และ NH10 ตามลำดับ โดยพบความหนาแน่น 4,974 และ 3,500 หน่วย (เซลล์หรือโคโลนี) ต่อลิตร ตามลำดับ (ตารางที่ 4) ขณะที่สถานี NH8 และ NH11 พบแพลงก์ตอนพืชน้อยมากเพียง 150 และ 156 หน่วยต่อลิตร ตามลำดับ ทั้งนี้สถานี NH11 อยู่ในบริเวณปากน้ำพุงที่มีน้ำไหลเข้าสู่หนองหารตลอดปี และพื้นท้องน้ำที่ค่อนข้างราบเรียบไม่มีพรรณไม้น้ำหนาแน่น ทำให้แพลงก์ตอนที่ไหลลงมาจากลำน้ำพุงมีไม่มากนัก และถูกผลักดันให้ล่องลอยออกนอกพื้นที่ตามกระแสน้ำ รวมทั้งลักษณะมวลน้ำที่ค่อนข้างขุ่นซึ่งเป็นการบดบังแสงที่ส่องลงสู่มวลน้ำ ทำให้แพลงก์ตอนพืชไม่สามารถเจริญเติบโตได้อีกด้วย
เมื่อพิจารณาองค์ประกอบทางชนิดของแพลงก์ตอนพืชที่พบในแหล่งน้ำหนองหารโดยเปรียบเทียบจำนวนสกุล (Genus) ในแต่ละกลุ่มดิวิชั่น (Division) แล้วนั้น พบว่าแพลงก์ตอนกลุ่มสาหร่ายสีเขียวใน Division Chlorophyta มีจำนวนสกุลที่พบมากที่สุด รองลงมาได้แก่ Division Chromophyta และสุดท้ายคือ Division Cyanophyta ซึ่งโดยทั่วไปแล้วแพลงก์ตอนพืชกลุ่มสาหร่ายสีเขียวนั้นมีความสำคัญในแหล่งน้ำจืดมากกว่าแพลงก์ตอนพืชในกลุ่มอื่น ในขณะที่สัดส่วนเชิงปริมาณของแพลงก์ตอนในแต่ละดิวิชั่นนั้น ก็เป็นไปในทิศทางเดียวกัน โดยDivision Chlorophyta มีจำนวนเซลล์ของแพลงก์ตอนพืชมากที่สุดในทุกฤดูกาลศึกษา โดยคิดเป็นสัดส่วนร้อยละ 57.59, 61.14, 67.82 และ 93.29 ในเดือนพฤศจิกายน 2560 เดือนมีนาคม 2561เดือนสิงหาคม 2561 และเดือนธันวาคม 2561 ตามลำดับ